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(一)概述:NGS測(cè)序在病原微生物檢測(cè)中的應(yīng)用?生產(chǎn)盒裝牛奶企業(yè)微生物檢測(cè)哪些項(xiàng)目 檢測(cè)步驟及所用培養(yǎng)基,培養(yǎng)時(shí)間是怎樣的 ?健明迪

(一)概述:NGS測(cè)序在病原微生物檢測(cè)中的運(yùn)用

? NGS技術(shù)在臨床上的運(yùn)用逐漸趨于成熟,從早期的腫瘤基因檢測(cè),到如今大熱的微生物病原核酸檢測(cè),NGS技術(shù)以其快速、準(zhǔn)確和高分辨率的特點(diǎn),發(fā)揚(yáng)著無(wú)可替代的作用。 ?

微生物在地球上無(wú)處不在,從陸地到陸地,從衣物到皮膚,甚至我們的身體外部。

繁衍、變異、自然選擇和生活妥協(xié),是一切生物必需閱歷的。

由于生命的*要義,是生活。

為了生活,必需妥協(xié),生物之間為了爭(zhēng)奪資源,以及生物與自然環(huán)境之間,都存在著妥協(xié) ,在這個(gè)進(jìn)程中,有些微生物可以與人類(lèi)戰(zhàn)爭(zhēng)共處,甚至互利共生,而有的微生物則會(huì)使人患病,通常有細(xì)菌、真菌、病毒、支原體,以及衣原體,這些就是臨床上的病原微生物。

冠狀病毒表示圖

自然選擇需求閱歷漫長(zhǎng)的進(jìn)程,但是近年來(lái)環(huán)境污染,藥物濫用,加快了病原微生物的退化速度,耐藥菌,超級(jí)菌的出現(xiàn),嚴(yán)重要挾著人類(lèi)安康。

還有一些微生物,原本與人類(lèi)沒(méi)有交集,原先只存在于自然界,而有人為了獵奇,食用野生植物,從而把這些植物身上攜帶的病毒帶到了人類(lèi)社會(huì),如本世紀(jì)初的非典病毒(Severe Acute Respiratory Syndromes, SARS)就是例子,這類(lèi)新型病毒對(duì)公共衛(wèi)生安康構(gòu)成了龐大的應(yīng)戰(zhàn),一般人的貪心,給全世界的人們帶來(lái)了龐大的災(zāi)難。

當(dāng)安康遭到了要挾,對(duì)付細(xì)菌,人類(lèi)發(fā)明了抗生素, 對(duì)付病毒,發(fā)明了抗病毒藥物,但要如何治療,*步是找出元兇,而這在臨床上往往存在困難。

傳統(tǒng)的血慣例,或許器官和組織的影像學(xué)目的可以判別感染的能夠性,但并不能作為確診的依據(jù),比如血慣例只能通知你能否有細(xì)菌或病毒感染,但不能通知你是什么細(xì)菌或病毒,還需求進(jìn)一步反省才干確診,以便有的放矢。

實(shí)驗(yàn)室反省,如抗原檢測(cè)、核酸檢測(cè)、代謝產(chǎn)物檢測(cè)以及毒素檢測(cè)才是明白感染、指點(diǎn)治療和判別預(yù)后的重要手腕。

  • 細(xì)菌和真菌檢測(cè)。通常需求先停止分別培育,再結(jié)合生化反響停止鑒定,并進(jìn)一步停止藥物敏理性實(shí)驗(yàn),這種形式是臨床微生物實(shí)驗(yàn)室習(xí)用的經(jīng)典形式,為臨床處置了很多關(guān)鍵效果,但是其周期長(zhǎng)、陽(yáng)性率低、通量高等弊端往往難以滿(mǎn)足臨床日益增長(zhǎng)的需求。
  • 病毒、支原體、衣原體檢測(cè)。難以像細(xì)菌一樣停止分別培育,通常采用分子生物學(xué)方法如聚合酶鏈?zhǔn)椒错懀≒olymerase Chain Reaction, PCR)測(cè)定核酸,靈敏快速,但只限于已知病原體的檢測(cè),且檢測(cè)結(jié)果提供的信息相對(duì)有限,難以處置由變異帶來(lái)的醫(yī)學(xué)效果。

為了克制傳統(tǒng)方法的缺乏,下一代測(cè)序技術(shù)(Next-generation sequencing technology,NGS)在病原微生物檢測(cè)中的應(yīng)用具有十分大的優(yōu)勢(shì),如:

  • 通量大,一次可檢測(cè)成百上千個(gè)物種,特別是未知的病原,測(cè)定其核酸序列是必不可少的手腕;
  • 直接測(cè)定病原微生物的核酸序列,能為臨床提供準(zhǔn)確的診斷依據(jù),如物種鑒定、分型以及耐藥突變等;
  • 更低的檢測(cè)限,即使病原微生物的豐度很低,也可以檢測(cè)到。

當(dāng)然,NGS的缺陷也是有的:

  • 相關(guān)于PCR,時(shí)效性處于優(yōu)勢(shì);
  • 本錢(qián)較高,暫時(shí)不會(huì)完全取代現(xiàn)行的慣例鑒定手腕。

即使有缺乏,但NGS的技術(shù)優(yōu)勢(shì)更為清楚,在疑問(wèn)微生物,以及難以培育甚至無(wú)法分別培育的少見(jiàn)菌屬的鑒定,特別是新型病原微生物的爆發(fā)盛行監(jiān)測(cè)方面,NGS快速、準(zhǔn)確和高分辨率的特點(diǎn),使其成為病毒鑒定的金規(guī)范,在盛行病學(xué)分型中發(fā)揚(yáng)著重要作用。

新型冠狀病毒(Corona Virus Disease 2019, COVID-19)正暴虐全球,目前尚無(wú)疫苗和*藥,人們除了戴口罩,留意團(tuán)體衛(wèi)生以及添加社交距離外別無(wú)他法,面對(duì)洶涌的疫情,再一次提示人類(lèi),要放下自己是萬(wàn)物之靈的高傲,由于微生物才是當(dāng)之無(wú)愧的地球*,它們?cè)谶@個(gè)星球上生活的歷史比人類(lèi)更長(zhǎng),種類(lèi)和數(shù)量也比人類(lèi)要多得多。

佩戴口罩防病毒感染

我們不能,也不應(yīng)該試圖消滅一切微生物。我們之間的關(guān)系,不只要對(duì)立,還有協(xié)作,但是當(dāng)我們的安康遭到要挾時(shí),也要勇于妥協(xié)。

物競(jìng)天擇,適者生活,人類(lèi)與微生物的協(xié)作與妥協(xié),必將永遠(yuǎn)停止下去。

發(fā)布于 2020-09-03 16:10

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