微生物檢測目的?微生物檢測包括哪些方面??(一)概述:NGS測序在病原微生物檢測中的運(yùn)用?健明迪
1. 接種細(xì)菌時(shí)必需穿任務(wù)服、戴任務(wù)帽。
2. 停止接種食品樣品時(shí),必需穿公用的任務(wù)服、帽及拖鞋,應(yīng)放在無菌室緩沖間,任務(wù)前經(jīng)紫外線消毒后運(yùn)用。
3. 接種食品樣品時(shí),應(yīng)在進(jìn)無菌室前用肥皂洗手,然后用75%酒精棉球?qū)⑹植翝崈?/b>。
4. 停止接種所用的吸管,平皿及培育基等必需經(jīng)消毒滅菌,翻開包裝未運(yùn)用完的器皿,不能放置后再運(yùn)用,金屬用具應(yīng)高壓滅菌或用95%酒精撲滅炙烤三次后運(yùn)用。
5. 從包裝中取出吸管時(shí),吸管尖部不能觸及外露部位,運(yùn)用吸管接種于試管或平皿時(shí),吸管尖不得觸及試管或平皿邊。
6. 接種樣品、轉(zhuǎn)種細(xì)菌必需在酒精燈前操作,接種細(xì)菌或樣品時(shí),吸管從包裝中取出后及翻開試管塞都要經(jīng)過火焰消毒。
7. 接種環(huán)和針在接種細(xì)菌前應(yīng)經(jīng)火焰炙烤全部金屬絲,必要時(shí)還要燒到環(huán)和針與桿的銜接處,接種結(jié)核菌和烈性菌的接種環(huán)應(yīng)在沸水中煮沸5min,再經(jīng)火焰炙烤。
8. 吸管吸取菌液或樣品時(shí),運(yùn)用相應(yīng)的橡皮頭吸取,不得直接用口吸。
1. 無菌間通向外面的窗戶應(yīng)為雙層玻璃,并要密封,不得隨意翻開并設(shè)有與無菌間大小相應(yīng)的緩沖間及推拉門,另設(shè)有0.5~0.7m2的小窗,以備進(jìn)入無菌間后傳遞物品。
2. 無菌間內(nèi)應(yīng)堅(jiān)持清潔,任務(wù)后用2%~3%煤酚皂溶液消毒,擦拭任務(wù)臺(tái)面,不得寄存與實(shí)驗(yàn)有關(guān)的物品。
3. 無菌間運(yùn)用前后應(yīng)將門關(guān)緊,翻開紫外燈,如采用室內(nèi)懸吊紫外燈消毒時(shí),需30W紫外燈,距離在1.0m處,照射時(shí)間不少于30min,運(yùn)用紫外燈,應(yīng)留意不得直接在紫外線下操作,以免惹起損傷,燈管每隔兩周需用酒精棉球悄然擦拭,除去下面灰塵和油垢,以增加紫外線穿透的影響。
4. 處置和接種食品標(biāo)本時(shí),進(jìn)入無菌間操作,不得隨意出入,如需求傳遞物品,可經(jīng)過小窗傳遞。
5. 在無菌間內(nèi)如需求裝置空調(diào)時(shí),則應(yīng)有過濾裝置。
微生物檢測用的玻璃器皿、金屬用具及培育基、被污染和接種的培育物等,必需經(jīng)滅菌前方能運(yùn)用。干熱和干冷高壓蒸氣鍋滅菌方法。
1.滅菌前預(yù)備 (1)一切需求滅菌的物品首先應(yīng)清洗晾干,玻璃器皿如吸管、平皿用紙包裝嚴(yán)密,如用金屬筒應(yīng)將下面通氣孔翻開。 (2)裝培育基的三角瓶塞,用紙包好,試管蓋好蓋,注射器須將管芯抽出,用紗布包好。
2.裝放 (1)干熱滅菌器:裝放物品不可過擠且不能接觸箱的四壁。 (2)大型高壓蒸氣鍋:放置滅菌物品區(qū)分包扎好,直接放入消毒筒內(nèi),物品之間不能過擠。
3.設(shè)備反省 (1)反省門的開關(guān)能否靈敏,橡皮圈有無損壞,能否平整。 (2)反省壓力表蒸氣排盡時(shí)能否停留在零位,關(guān)好門和蓋,通蒸氣或加熱后,觀察能否漏氣,壓力表與溫度計(jì)所標(biāo)示的狀況能否吻合,管道有無梗塞。 (3)對有自動(dòng)電子順序控制裝置的滅菌器,運(yùn)用前應(yīng)反省規(guī)則的順序,能否契合于停止滅菌處置的要求。
4.滅菌處置
(1)干熱滅菌法: 此法順應(yīng)于在干熱狀況下,不損壞、不蛻變、不蒸發(fā)的物品、較常用于玻璃器皿、金屬制品、陶瓷制品等的滅菌。 ① 器械器皿應(yīng)清洗后再干烤,以防附著在外表的污物炭化。 ② 滅菌時(shí)安放物品不能過擠,不要直接接觸底和箱壁,物品之間留有空隙。 ③ 滅菌時(shí)將箱門關(guān)緊,接上電源,先將排氣孔翻開約30min,掃除滅菌器中的冷空氣,溫度升至160℃調(diào)理指示燈,維持1.5~2h。 ④ 滅菌終了后或溫度升溫進(jìn)程中,須在60℃以下才干翻開箱門。
(2)手提式高壓鍋或立式壓力蒸氣滅菌器的運(yùn)用應(yīng)按下列步驟停止: ① 手提式高壓鍋在主體內(nèi)參與3L清水,立式高壓鍋加水16L(重復(fù)運(yùn)用時(shí)應(yīng)將水量補(bǔ)足,水變混濁需改換); ② 手提式壓力鍋將頂蓋上的排氣管拔出消毒桶內(nèi)壁的方管中(無軟管或軟管銹蝕分裂的滅菌器不得運(yùn)用); ③ 蓋好頂蓋擰緊,勿使漏氣;置滅菌器于火源上加熱,立式壓力鍋通上電源,并翻開頂蓋上的排氣閥放了冷氣(水沸騰后排氣10~15min); ④ 封鎖排氣閥,使蒸氣壓上升到規(guī)則要求,并維持規(guī)則時(shí)間(按滅菌物品性質(zhì)與有關(guān)狀況而定); ⑤ 到達(dá)規(guī)則時(shí)間后,對需枯燥的物品,立刻翻開排氣閥排出蒸氣,待壓力恢復(fù)到零時(shí),自然冷卻至60℃后開蓋取物,如為液體物品,不要翻開排氣閥,而應(yīng)立刻將鍋去除熱源,待自然冷卻,壓力恢復(fù)至零,溫度降到60℃以下,再開蓋取物,以防突然減壓液體猛烈沸騰或容器爆破。
(3)臥式壓力鍋蒸氣滅菌器的運(yùn)用按下列步驟停止: ① 關(guān)緊鍋門,翻開進(jìn)氣閥,將蒸氣引入夾層停止預(yù)熱,夾層內(nèi)冷空氣經(jīng)阻氣器自動(dòng)排出; ② 夾層到達(dá)預(yù)定溫度后,翻開鍋室進(jìn)氣閥,將蒸氣引入鍋室,鍋室內(nèi)冷空氣經(jīng)鍋室阻氣器自動(dòng)排出; ③ 待鍋室到達(dá)規(guī)則的壓力與溫度時(shí),調(diào)理進(jìn)氣閥,使堅(jiān)持恒定; ④ 自然或人工降溫至60℃再開門取物,不得運(yùn)用快速排出蒸氣法,以防突然降壓,液體猛烈沸騰或容器爆破; ⑤ 運(yùn)用自動(dòng)順序控制式壓力蒸氣滅菌器,在放好物品關(guān)緊門后,應(yīng)依據(jù)物品類別按動(dòng)相應(yīng)開關(guān),以便按要求順序自動(dòng)停止滅菌,滅菌時(shí)必需應(yīng)用附設(shè)儀表記載溫度與時(shí)間以備查,操作要求應(yīng)嚴(yán)厲依照廠家說明書停止;
5.滅菌溫度與時(shí)間 (1) 干熱滅菌器滅菌溫度160℃,1.5~2h。 (2) 壓力蒸氣滅菌鍋滅菌溫度與時(shí)間
1.滅菌方法: 應(yīng)用不加壓力的蒸氣滅菌,某些物質(zhì)經(jīng)高壓蒸氣滅菌容易破壞,可用此法滅菌。 (1)將欲滅菌物品置于鍋內(nèi),蓋上頂蓋,翻開排水口,使器內(nèi)余水排盡。 (2)封鎖排水口,翻開進(jìn)氣門,依據(jù)需求消毒10~20min。 (3)滅菌終了封鎖進(jìn)氣門,取出物品待冷至室溫溫度,放入37℃溫箱過夜,次日仍按上述方法消毒,如此三次,即可到達(dá)滅菌目的。
2.血清凝結(jié)器運(yùn)用方法: 培育基中含有血清或雞蛋特殊成份時(shí),因高熱會(huì)破壞其營養(yǎng)成份,故用高溫,可使血清凝結(jié),又可到達(dá)滅菌目的: (1)在運(yùn)用該法滅菌的血清等分裝時(shí),需嚴(yán)厲遵守?zé)o菌操作,試管、平皿也經(jīng)滅菌后運(yùn)用; (2)將培育基按要求使成斜面或高層,加足水后,接上電源,升溫75~90℃一小時(shí)后滅菌,放37℃溫箱過夜,再如此滅菌三次。
3.煮沸消毒: 可用煮鍋或煮沸消毒器,水沸騰后再煮5~15 min,也可在水中參與2%石炭酸煮沸5min,參與0.02%甲醛,80℃煮60min均可到達(dá)滅菌目的,但選用煮沸消毒的增消劑時(shí),應(yīng)留意對物品的腐蝕性。
4.滅菌處置: 滅菌后物品,按正常狀況已屬無菌,從滅菌器中取出應(yīng)細(xì)心反省放置,以免再度污染; (1)物品取出,隨即反省包裝的完整性,若有破壞或棉塞脫掉,不可作為無菌物品運(yùn)用; (2)取出的物品,如為包裝有清楚的水浸者,不可作為無菌物品運(yùn)用; (3)培育基或試劑等,應(yīng)反省能否契合到達(dá)滅菌后的色澤或形狀,未到達(dá)者應(yīng)廢棄; (4)啟閉式容器,在取出時(shí)應(yīng)將篩孔封鎖; (5)取出的物品掉落在地或誤放不潔處,或沾有水液,均視為遭到污染,不可作為無菌物品運(yùn)用; (6)取出的合格滅菌物品,應(yīng)寄存于貯藏室或防塵柜內(nèi),嚴(yán)禁與未滅菌物品混放; (7)凡屬合格物品,應(yīng)標(biāo)有滅菌日期及有效期限; (8)每批滅菌處置完成后,記載滅菌品名、數(shù)量、溫度、時(shí)間、操作者。
微生物實(shí)驗(yàn)所用實(shí)驗(yàn)器材、培育物等未經(jīng)消毒處置,一概不得帶出實(shí)驗(yàn)室。
1. 經(jīng)培育的污染資料及廢棄物應(yīng)放在嚴(yán)密的容器或鐵絲筐內(nèi),并集中寄存在指定地點(diǎn),待一致停止高壓滅菌。
2. 經(jīng)微生物污染的培育物,必需經(jīng)121℃,30min高壓滅菌。
3. 染菌后的吸管,運(yùn)用后放入5%煤酚皂溶液或石炭酸液中,*少浸泡24h(消毒液體不得低于浸泡的高度)再經(jīng)121℃,30min高壓滅菌。
4. 涂片染色沖洗片的液體,普通可直接沖入下水道,烈性菌的沖洗液必需沖在燒杯中,經(jīng)高壓滅菌前方可倒入下水道,染色的玻片放入5%煤酚皂溶液中浸泡24h后,煮沸洗濯。做凝集實(shí)驗(yàn)用的玻片或平皿,必需高壓滅菌后洗濯。
5. 打碎的培育物,立刻用5%煤酚皂溶液或石炭酸液噴灑和浸泡被污染部位,浸泡半小時(shí)后再擦拭潔凈。
污染的任務(wù)服或停止烈性實(shí)驗(yàn)所穿的任務(wù)服、帽、口罩等,應(yīng)放入公用消毒袋內(nèi),經(jīng)高壓滅菌前方能洗濯。
培育基制備的質(zhì)量將直接影響微生物生長,由于,各種微生物對其營養(yǎng)要求不完全相反,培育目的的不同,各種培育基制備要求如下:
1. 依據(jù)培育基配方的成分按量稱取,然后溶于蒸餾水中,在運(yùn)用前對運(yùn)用的試劑藥品應(yīng)停止質(zhì)量檢驗(yàn)。
2. pH測定及調(diào)理:pH測定要在培育基冷至室溫時(shí)停止,因在熱或冷的狀況下,其pH有一定差異,當(dāng)測定好時(shí),按計(jì)算量參與堿或酸混勻后,應(yīng)再測試一次。培育基pH值一定要準(zhǔn)確,否則會(huì)影響微生物的生長或影響結(jié)果的觀察。但需留意因高壓滅菌可影響一些培育基的pH降低或降低,故不宜滅菌壓力過高或次數(shù)太多,以免影響培育基的質(zhì)量,指示劑、去氧膽酸鈉、瓊脂等普通在調(diào)完pH后再參與。
3. 培育基需堅(jiān)持廓清,便于觀察細(xì)菌的生長狀況,培育基加熱煮沸后,可用脫脂棉花或絨布過濾,以除去沉淀物,必要時(shí)可用雞蛋白廓清處置,所用瓊脂條要預(yù)先洗凈晾干后運(yùn)用,防止因瓊脂含雜質(zhì)而影響透明度。
4. 盛裝培育基不宜用鐵、銅等容器,運(yùn)用洗凈的中性硬質(zhì)玻璃容器為好。
5. 培育基的滅菌既要到達(dá)完全滅菌目的,又要留意不因加熱而降低其營養(yǎng)價(jià)值,普通121℃,15min即可,如為含有不耐高熱物質(zhì)的培育基如糖類、血清、明膠等,則應(yīng)采用高溫滅菌或間歇法滅菌,一些不能加熱的試劑如亞碲酸鉀、卵黃、TTC、抗菌素等,待基礎(chǔ)瓊脂高壓滅菌后涼至50℃左右再參與;
6. 每批培育基制備好后,應(yīng)做無菌生長實(shí)驗(yàn)及所檢菌株生長實(shí)驗(yàn)。假設(shè)是生化培育基,運(yùn)用規(guī)范菌株接種培育,觀察生化反響結(jié)果,應(yīng)呈正常反響,培育基不應(yīng)貯存過久,必要時(shí)可置4℃冰箱寄存。
7. 目前,各種枯燥培育基較多,每批需用規(guī)范菌株停止生長實(shí)驗(yàn)或生化反響觀察,各種培育基用相應(yīng)菌株生長實(shí)驗(yàn)良好前方可運(yùn)用,新購進(jìn)的或寄存過久的枯燥培育基,在配制時(shí)也應(yīng)測pH,運(yùn)用時(shí)需依據(jù)產(chǎn)品說明書用量和方法停止。
8. 每批制備的培育基所用化學(xué)試劑、滅菌狀況及菌株生長實(shí)驗(yàn)結(jié)果、制造人員等應(yīng)做好記載,以備查詢。
1.所采集的檢驗(yàn)樣品一定要具有代表性,采樣時(shí)應(yīng)首先對該批食品原料、加工、運(yùn)輸、貯藏方法條件、周圍環(huán)境衛(wèi)生狀況等停止詳細(xì)調(diào)查,反省能否有污染源存在。
2.依據(jù)食品的種類及數(shù)量,采樣數(shù)量及方法應(yīng)按規(guī)范檢驗(yàn)方法的要求停止。
3.采樣應(yīng)留意無菌操作,容器必需滅菌,防止環(huán)境中微生物污染,容器不得運(yùn)用煤酚皂溶液,用新潔爾滅、酒精等消毒藥物滅菌,更不能含有此類消毒藥物或抗生素類藥物,以防止殺死樣品中的微生物,所用剪、刀、匙用具也需滅菌方可運(yùn)用。
4.樣品采集后應(yīng)立刻送往檢驗(yàn)室停止檢驗(yàn),送檢進(jìn)程中普通不超越3h,如,路程較遠(yuǎn),可保管在1~5℃環(huán)境中,如需冷凍者,則在凍存形狀下送檢。
5.檢驗(yàn)室收到樣品后,停止注銷(樣品稱號(hào)、送檢單位、數(shù)量、日期、編號(hào)等),觀察樣品的外觀,假設(shè)發(fā)現(xiàn)有下列狀況之一者,可拒絕檢驗(yàn): (1)樣品經(jīng)過特殊高壓、煮沸或其他方法殺菌者,失掉代表原食品檢驗(yàn)意義者; (2)瓶、袋裝食品已啟開者,熟肉及其制品、熟禽等食品已折碎不完整者,即失掉原食品外形者(食物中毒樣品除外); (3)按規(guī)則采樣數(shù)量缺乏者; 對送檢契合要求的樣品,檢驗(yàn)室收到后,應(yīng)立刻停止檢驗(yàn),假設(shè)條件不具有,應(yīng)置4℃冰箱寄存,及時(shí)預(yù)備發(fā)明條件,然后停止檢驗(yàn)。
6.樣品檢驗(yàn)時(shí),依據(jù)其不異性狀,停止適當(dāng)處置。 (1)液體樣品接種時(shí),應(yīng)充沛混合平均,按量吸取停止接種。 (2)固體樣品,用滅菌刀、剪取其不同部位共25g,置于225mL滅菌生理鹽水或其他溶液中,用均質(zhì)器攪碎混勻后,按量吸取接種。 (3)瓶、袋裝食品運(yùn)用滅菌操作啟開,依據(jù)性狀選擇上述方法處置后接種。
1. 檢驗(yàn)室收到樣品后,首先停止外觀檢驗(yàn),及時(shí)依照國度規(guī)范檢驗(yàn)方法停止檢驗(yàn),檢驗(yàn)進(jìn)程中要仔細(xì)、擔(dān)任、嚴(yán)厲停止無菌操作,防止環(huán)境中微生物污染。
2. 樣品檢驗(yàn)進(jìn)程中所用方法、出現(xiàn)的現(xiàn)象和結(jié)果等均要用文字寫出實(shí)驗(yàn)記載,以作為對結(jié)果剖析、判定的依據(jù),記載要求詳細(xì)、清楚、真實(shí)、客觀、不得涂改和偽造。
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? NGS技術(shù)在臨床上的運(yùn)用逐漸趨于成熟,從早期的腫瘤基因檢測,到如今大熱的微生物病原核酸檢測,NGS技術(shù)以其快速、準(zhǔn)確和高分辨率的特點(diǎn),發(fā)揚(yáng)著無可替代的作用。 ?
微生物在地球上無處不在,從陸地到陸地,從衣物到皮膚,甚至我們的身體外部。
繁衍、變異、自然選擇和生活妥協(xié),是一切生物必需閱歷的。
由于生命的*要義,是生活。
為了生活,必需妥協(xié),生物之間為了爭奪資源,以及生物與自然環(huán)境之間,都存在著妥協(xié) ,在這個(gè)進(jìn)程中,有些微生物可以與人類戰(zhàn)爭共處,甚至互利共生,而有的微生物則會(huì)使人患病,通常有細(xì)菌、真菌、病毒、支原體,以及衣原體,這些就是臨床上的病原微生物。
自然選擇需求閱歷漫長的進(jìn)程,但是近年來環(huán)境污染,藥物濫用,加快了病原微生物的退化速度,耐藥菌,超級(jí)菌的出現(xiàn),嚴(yán)重要挾著人類安康。
還有一些微生物,原本與人類沒有交集,原先只存在于自然界,而有人為了獵奇,食用野生植物,從而把這些植物身上攜帶的病毒帶到了人類社會(huì),如本世紀(jì)初的非典病毒(Severe Acute Respiratory Syndromes, SARS)就是例子,這類新型病毒對公共衛(wèi)生安康構(gòu)成了龐大的應(yīng)戰(zhàn),一般人的貪心,給全世界的人們帶來了龐大的災(zāi)難。
當(dāng)安康遭到了要挾,對付細(xì)菌,人類發(fā)明了抗生素, 對付病毒,發(fā)明了抗病毒藥物,但要如何治療,*步是找出元兇,而這在臨床上往往存在困難。
傳統(tǒng)的血慣例,或許器官和組織的影像學(xué)目的可以判別感染的能夠性,但并不能作為確診的依據(jù),比如血慣例只能通知你能否有細(xì)菌或病毒感染,但不能通知你是什么細(xì)菌或病毒,還需求進(jìn)一步反省才干確診,以便有的放矢。
實(shí)驗(yàn)室反省,如抗原檢測、核酸檢測、代謝產(chǎn)物檢測以及毒素檢測才是明白感染、指點(diǎn)治療和判別預(yù)后的重要手腕。
為了克制傳統(tǒng)方法的缺乏,下一代測序技術(shù)(Next-generation sequencing technology,NGS)在病原微生物檢測中的應(yīng)用具有十分大的優(yōu)勢,如:
當(dāng)然,NGS的缺陷也是有的:
即使有缺乏,但NGS的技術(shù)優(yōu)勢更為清楚,在疑問微生物,以及難以培育甚至無法分別培育的少見菌屬的鑒定,特別是新型病原微生物的爆發(fā)盛行監(jiān)測方面,NGS快速、準(zhǔn)確和高分辨率的特點(diǎn),使其成為病毒鑒定的金規(guī)范,在盛行病學(xué)分型中發(fā)揚(yáng)著重要作用。
新型冠狀病毒(Corona Virus Disease 2019, COVID-19)正暴虐全球,目前尚無疫苗和*藥,人們除了戴口罩,留意團(tuán)體衛(wèi)生以及添加社交距離外別無他法,面對洶涌的疫情,再一次提示人類,要放下自己是萬物之靈的高傲,由于微生物才是當(dāng)之無愧的地球*,它們在這個(gè)星球上生活的歷史比人類更長,種類和數(shù)量也比人類要多得多。
我們不能,也不應(yīng)該試圖消滅一切微生物。我們之間的關(guān)系,不只要對立,還有協(xié)作,但是當(dāng)我們的安康遭到要挾時(shí),也要勇于妥協(xié)。
物競天擇,適者生活,人類與微生物的協(xié)作與妥協(xié),必將永遠(yuǎn)停止下去。
微生物檢測目的?微生物檢測包括哪些方面??(一)概述:NGS測序在病原微生物檢測中的運(yùn)用?健明迪
醫(yī)藥教育協(xié)會(huì)-Linda:二、適用范圍: 微生物實(shí)驗(yàn)室; 三、責(zé)任人: 實(shí)驗(yàn)室、微生物檢測員; 四、平安留意事項(xiàng): 嚴(yán)厲遵照無菌操作,防止微生物...Copyright ? 2023.廣州市健明迪檢測有限公司 .粵ICP備2022046874號(hào)技術(shù)文章 檢測服務(wù) 相關(guān)資訊